近未来时代，日本警察厅特殊解析研究所（简称特解研）建立了的国民遗传基因情报数据库，在此基础上运行的DNA搜查系统可以根据遗留在犯罪现场的毛发、体液等证物迅速且准确地锁定犯罪者，使日本警方破案率和破案效率飞速上升。在此基础上，国会提出了DNA法案，希望将DNA数据作为搜查过程中的正规可利用情报，并进一步呼吁国民主动提供DNA数据，由国家同意管理个人DNA情报。
然而，并不是所有案件都能依靠DNA搜查系统解决。一连十三起性侵杀人事件，犯人留下的DNA无法在系统中找到吻合的数据，故被命名为NF13（NOT FOUND 13）。对此，DNA搜查系统主任解析员神乐坚称是数据不足而非系统不完善。
一波未平一波又起，在新世纪大学医院VIP楼层，DNA搜查系统编程者、天才数学家蓼科早树与他的哥哥被枪杀。枪支型号与NF13相同，以浅间玲司为首的搜查科开始了现场调查，种种迹象皆把嫌疑指向了曾在案发前出现在医院五楼的神乐。另一边，神乐对留在现场的嫌犯毛发进行分析，结果竟然直指自己，心里有所猜测的神乐在新属下白鸟里沙的暗中帮助下开始了逃亡与寻找真相的旅途。
双重人格、秘密程序、脑域研究、白金数据……一切都将从神乐和浅间玲司的双视角向读者揭晓。